SSL证书本身是一个通用的加密标准，通常不会直接与Java Development Kit（JDK）的版本相关联。SSL证书是用于在客户端和服务器之间建立安全连接的数字证书，而JDK是Java程序开发和运行的环境。不过，SSL/TLS协议的实现和支持在不同版本的JDK中可能会有所不同。

要确保SSL证书在JDK 1.4、1.5、1.6等低版本中兼容，可以采取以下措施：

1. **使用通用的加密套件**：选择一个广泛支持的加密套件（cipher suite），这样无论在哪个版本的JDK上，都能保证SSL连接的兼容性。

2. **更新JDK**：虽然低版本的JDK，但更新到更高版本的JDK（如果可能的话）可以提供更好的安全性和对新加密标准的兼容。

3. **使用Java安全提供者**：如果你使用的是自定义的Java安全提供者，确保它在所有目标JDK版本上都能正常工作。

4. **配置服务器和客户端**：在服务器和客户端配置中指定支持的协议版本和加密套件，以确保它们与低版本的JDK兼容。

5. **使用Java Cryptography Architecture (JCA) 和 Java Cryptography Extension (JCE)**：确保使用的加密算法和提供者与JDK版本兼容。

6. **测试**：在所有目标JDK版本上进行彻底的测试，以确保SSL连接的稳定性和安全性。

7. **考虑使用TLS版本**：JDK 1.4默认支持TLS 1.0，JDK 1.5开始支持TLS 1.1，而JDK 1.6支持TLS 1.2。根据你的最低支持版本，选择合适的TLS版本。

8. **使用兼容的库**：如果你的应用程序依赖于特定的加密库，确保这些库与低版本的JDK兼容。

9. **遵循最佳实践**：遵循安全最佳实践，比如使用强加密算法，避免使用已知有安全漏洞的协议和算法。

请注意，随着时间的推移，一些旧的JDK版本可能不再受到支持，使用这些版本可能会带来安全风险。因此，如果可能的话，升级到更高版本的JDK是一个更安全的选择。